蜂巢药用价值也很高，常用新鲜干净的蜂巢治疗鼻炎。新蜂巢还具有治疗肝炎、鼻炎和风湿性关节炎等疾病的疗效。研究表明，蜂巢制剂有促进机体细胞免疫功能的作用，蜂巢浸液既对乙型肝炎表面抗原有灭活作用，也对金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、大肠杆菌、痢疾杆菌、伤寒杆菌和普通变形杆菌等都有很强的抑制力；对烟曲霉、黄曲霉、茄镰菌、明串珠菌等真菌也有抑制作用。蜂巢的化学成分很复杂，主要含有蜂蜡、树脂、油脂、色素、鞣质、糖类、有机酸、脂肪酸、甙类、酶和昆虫激素等。