王琪的三首著名歌是：1、《可可托海的牧羊人》《可可托海的牧羊人》是王琪演唱的一首歌曲，由王琪作词作曲，达吾然编曲，收录于王琪2020年5月8日发行的专辑《可可托海的牧羊人》中。2021年2月11日，王琪在《2021年中央广播电视总台春节联欢晚会》上演唱《可可托海的牧羊人》2、《万爱千恩》《万爱千恩》是由王琪作词、作曲，并演唱的一首流行歌曲，歌曲时长为5分21秒，发行于2019年4月10日。收录于同名专辑《万爱千恩》中。3、《情人迷》《情人迷》是由王琪作词、作曲，王琪演唱的歌曲，发行于2017年8月7日。收录于同名专辑《情人迷》中。该歌曲是广泛流传于东北的民间小调，虽然版本不尽相同，但是对于土生土长的东北人，王琪推出此曲的目的就是要弘扬民族民间文化，不让遗落在民间的艺术瑰宝被时间所淡忘。